ようやく回復か

けだるい日曜の午後。結局二週間苦しめられた風邪からようやく回復しつつある。ひどかった肩こりと頭痛が今日から少しましになってきた。他の三人はシンシアのお別れパーティに行ったので、今日は家で一人でゆっくり休ませてもらう。

峠越す

週末にそろそろ治りそうと思っていた風邪だったが、一昨日と昨日ともう一度症状が悪化してえらい頭痛に悩まされた。それも今日辺りから治まってようやく回復しつつあるけど、ほんまにきつかった。さて、頭痛に苛まれながらも金土日と三日間毎晩三時頃までオフィスにこもってひたすらVolumestで核の体積を量り続けていたのだが、その甲斐あってかなり一貫性のあるデータが取れた。これはなかなかイイ。これでfigureもほぼ完成するので、あとはサプリメントのデータを集めて文章を固めていくだけか。ようやく峠を越えて完成が見えてきたという感じ。

そんなこんなで論文に集中している間にドイツでの学会が二週間後に迫ってきた。まぁ今回の学会はポスター発表だし、どちらかというとちょっと新しいものを勉強しに行くという感じなのでそれほど気負うところはないのだけども、そろそろこちらの準備も始めたいところ。

五週間

五週間目。どうやら右半分の日当りが良くないからか、右と左で成長に差が出てきた。

同じようなものをもう一つ作ろうということになって、現在場所を思案中。こちらは花壇ではなくシソやシラントロを植えるための家庭菜園にする予定。

Supermoon

今夜の満月は月と地球の距離が最も近くなるスーパームーンなんだそうな。大学の立体駐車場の屋上から撮影。

巨大G

昨晩、家の中でフロリダ名物巨大ゴキブリが出現したのだが、不覚にも取り逃がしてしまった。。。なんかソファの裏側に入っていったきり出てきやがらないのである。あんな生き物がどこかにいると思うだけでそわそわして落ち着かないので、とりあえずゴキブリ用毒饅頭を設置。去年は夏の間もほとんど家の中で奴らに出会うことはなかったのだが、どうしたことだろう。まぁ去年はその代わりにネズミが出たけどね。
最近外はもう真夏のような暑さなのだが、やっぱり結構ひどい風邪をひいてしまった。まぁもう少しで治まりそうな感じではあるけど、この三日間ほど結構しんどかった。しかしながらしんどかったのもあって、この三日間はほとんどオフィスにこもって論文のFigure作りをしていたので、ようやくFigureも出来てきた。来週からはいよいよボスと話し合いながら仕上げにかかろう。

五年前の

昨日のひどい肩こりに頭痛、デスクワークのしすぎかと思っていたけど、どうやら風邪をひきかけているようだ。今朝になってエライ喉が痛くなってきた。で、ソウシロは熱を出し始めた。うーむ、なんとか気合いで勝ちたいところなんだけども、結構強い風邪な気がする。。。

今日は、今までに撮りためたコンフォーカル画像の中から論文のFigureに使用する写真を探していたのだが、古いものでは２００７年に撮った写真もある。つまりこの論文は５年ほども前からちょっとずつ溜めてきたデータからなっているということになるか。それにしても面白いことに、この５年前に吟味したはずの画像を今一度よーく見てみると、当時は注目していなかったというか気付いていなかった現象がちゃんと写り込んどるんやね。なんていうのか、実は普段一生懸命実験してコンフォーカルで写真を撮ってまでしているのに、こんな風に注目している以外の部分で見逃してしまっている重要なことって結構多いんやろなぁと思う訳ですわ。

書き直し

この三日間ほど、もう一度論文原稿の執筆に取り組んでいる。そのせいか昨日辺りからひどい肩こりになってしまって、今日は朝から頭が痛かったので家でゆっくり執筆活動させてもらった。この原稿は一度二月に書き上げたのだけども、その後追加実験をやっているうちに書き足すべきものが結構出てきたので、それに伴って全体的な流れも調整したという感じ。ということで一応本文は書き終えた。初回投稿前に全体的に書き直すなんてことをしたのは今回が初めてかも。この二ヶ月でレビュー→追加実験→リビジョンというプロセスを自分一人でしていたことになる。へんなの。まぁでもこれでやっと投稿できる目処がついた。あとは今週、figureとfigure legendを作ってしまおう。

Dinastia Vivanco Crianza

Dinastia Vivanco Crianza 2008

スペインはリオハのテンプラニーリョ。コスコで１５ドルくらいだったかな。昨日飲んでみたときは、どうも強い樽の香りがこのワインの繊細な味を隠してしまっているような気がしたのだが、やっぱり今日残りの半分を飲んでみたら花開いたような感じだった。カベルネに似たイイ香りにたくさんのベリーやイチゴの味が広がるのだが、樽の香りがこれを上品にまとめている。イイ。

四週間目

四週間経った。このところ毎晩のように何かの野生動物がちょこちょこと花壇を掘り起こしに来るんだけども、みんななかなか順調に伸びている。

系譜

自分はハエ研究者のどの系譜の末裔に当たるのか、そんなことを検索できるオモシロサイトがあった。ちなみに自分はモーガンから見るとだいたい六代目に当たるようだ。

↓

FlyTree

Torreya State Park

今日は、町から車で一時間ほど西へ行ったところにあるTorreya State Parkという州立公園でラボのピクニックパーティの予定だった。朝９時半頃に集合ということだったのだけども、どうせ昼頃にバーベキューが始まるんだろうとか思ってゆっくり１１時頃に行ったらみんなが見当たらない。人っ子一人いない広いピクニックサイトから森の中へトレイルが伸びていたので、このトレイルの先のどこかに別のピクニックサイトがあるんかもなぁ、とか思って家族四人でぶらぶらとこの森の中の小道を散歩した。結局ラボのみんなを見つけることはできなかったのだけども、色んな動物の鳴き声が聞こえてくる深い森の中は涼しくて空気がおいしくて、なんだか心が癒されたのでそれで満足して帰ってきた。

これは森の中で見つけた大きくて美しいヤスデ。

で、夜にラボに行ったらドンちゃんがいて、どうやらみんなは早々にピクニックパーティを切り上げて、その後あのトレイルをもっと奥の方へ歩いて行っていたんだそうな。でも途中でダポンテのガールフレンドが毒ヘビに足をかまれたそうで、引き上げてきて救急車を呼んだりして大変だったとのこと。まぁさほど強い毒を持ったヘビではなかったようで大丈夫だったらしいけど、うちらも同じ道を歩いていたことを思うとちょっと怖いな。

定点観測

蒔いた種のほとんどがこの一週間で芽を出した。それにしても球根から出てきた芽の成長はすごいな。

McManis Pinot Noir

McManis Pinot Noir 2010

プラムのような香り。飲み始めはとても飲みやすいフルーティでジュースのような軽めのワインだと思ったけど、飲んでいるうちにだんだんとコクが出てきて濃いイチゴやサクランボのような味わいに。これは旨い。たいがいは二人でボトル半分にしているのだけども、昨晩は思わずあっさりと一本空けてしまった。近所の酒屋でなんとたったの１０ドル。

リングケナール

先週のジャーナルクラブでジャッキーが発表していた論文。

J. Cell Sci. 124: 4077–4086.

Intercellular protein movement in syncytial Drosophila follicle cells

ring canalと言えば、Dr. LC。これは余談だけども、こないだこの「canal」の発音についてドンちゃんとキャメロンと話していて、アメリカ人のキャメロンによると「ケーナル」ではなくて「ケナール」だよと。「へぇ、じゃあリングケーナルって発音したら奇妙に聞こえる訳？」と聞いてみたら「そりゃそうさ、それだとring kennel（円形の犬小屋）に聞こえるよ。」だと。なるへそ、リングケナールね。

で、この論文ですが、平たく言うと、follicle cellやimaginal discのようなsomatic cellにもring canalがあって、実際にcytoplasmic proteinが通過してまっせ、という話。エェマジで？ゆー話ですが、実はこれを聞いて自分はそれほど驚いた訳でもなかった。というのも今までずっとfollicleを見てきた中で、隣接している細胞の細胞質が一部分でつながっている「syncytial」な感じのものをよく見ていたので、実はそうなんかもなぁとか思っていたのだ。だいたいfollicleにもring canalがあるということ自体は前にどこかで読んで知っていたような気がする。まぁimaginal discのような上皮細胞にもring canalがあるとは聞いたことがなかったけど、本当にimaginal discのものもfunctionalなring canalなんだろうか。。。ちなみにこの論文によれば、follicle cellのring canalはgap junction（1.5 nm）よりもはるかに大きい、直径２５０nmほどもあるintercellular bridge、というか細胞同士をつなぐ「穴」な訳で、実際に小さめのタンパクなら物理的な拡散によって隣の細胞へ移動している、ということをFLIPによってブリーチした細胞の隣の細胞からのGFPの拡散による流入を観察することによって証明している。しかしながら、imaginal discではGFP-taggedのVisgunとPavarotti（ヘンな名前）の細胞膜上のpunctate localization patternが示されているだけで、機能を調べる実験は全く行われていない。

しかし本当にそうだということになると、これはちょっとちゃんと考慮に入れるべきなのかも知れない。だいたい上皮細胞達は普段コレをどういう風に使っとんねんなと。この穴を介したnon-cell-autonomousなintercellular signal transductionってどれぐらいあるんかいねぇ。。。

それにしても、telophaseのcleavage furrowに現れるGFP::Pav-KLPによってマークされたcontractile ringが、キュッと締め付けられてring canalになる様子を捉えたタイムラプスはなかなかビューチフルやね。

この下の写真は自分が随分前に撮ったgermline（nurse cell）のリングケナール。germlineのはCheeriosをバラまいたみたいな感じがかわいくて好き。

二ヶ月先

今日ついに注文していたミュータントのハエがはるばる中国から到着。長旅にもかかわらずウジ虫達は元気そうにバイアルの中を這い回っていた。このmutant alleleのhomozygous backgroundで、今見ている違う遺伝子のmutant cloneのphenotypeを見たいのだが、そのためには合計８クロス、４世代に渡る久しぶりのビッグクロスが必要。結果を見るのは二ヶ月先か。。。考えてみりゃ一つの実験に二ヶ月というのは結構長いんだけども、vivoでこういうシチュエーションを作り出すことが出来るのはハエだけやからね。と言っても、とりあえずはこのmutant自体のphenotypeがすでにRNAiで得られているものと同じかどうかを確認することからまず始めないと、ということで今日の午後早速長旅を終えたウジ虫君達を数匹解剖したけど、もしかしたら長旅の疲れがphenotypeに何らかの影響を与えているかも知れんことを考えたら勇み足だったかな。。。

サーカスとお別れパーティ

先の週末、土曜日は昼からロウチビと二人でFSUのFlying High Circusを見に行った。以前にも観たことがあるのだけども、学生がやっているとはいえやはりなかなか本格的なサーカスで、今回も子供でなくても十分に楽しめる内容だった。パンフレットで出演者のプロフィールを見てみると本当に普通の学生達がやっているようで、Biologyの学生も何人か見つけた。

日曜日は朝からMaclay gardenでシンシア一家のお別れパーティ。シンシア一家はお父さんのエリックがMITに転勤することになったのでボストンへ引っ越しすることに。シンシア一家との付き合いはもう五年ほどになるのか。最近は子供達が違う学校になったこともあってそれほど会っていなかったのだけども、ユンナとシンシアとの出会いがこの町でのうちの家族の交際範囲を大きく広げるきっかけの一つだったんだなぁ、とちょっとしみじみ考えた。そういやシンシアの家族と一緒にサンクスギビングを祝ったこともあった。ちょっと寂しくなる。

花壇

二週間前にバックヤードに作った花壇。蒔いた種がぐいぐい芽を出し始めた。

Koonunga Hill Cabernet Merlot

Penfolds Koonunga Hill Cabernet Merlot 2007

オーストラリアPenfoldsの低価格シリーズ、Koonunga Hill。本当はこのKoonunga HillのShiraz Cabernetを買いたかったのだけども、あいにく近所のPublixになかったのでCabernet Merlotにしてみた。Cabernet Sauvignon 67%、Merlot 33%。ふむ、まぁ旨いよ。ロウチビ曰く、ミントの香り。辛口のミディアムボディという感じ。かなりあっさりしてるけど、まぁ１０ドル以下だし。やっぱりShiraz Cabernetを試してみたいな。

Totally unexpected

昨日のコンフォーカルで、残された二つの実験のうち一つの結果を確かめてみたらやっぱりネガチブだった。のだが、よく見てみたらネガチブどころかearly stageでは予想とは完全に逆の結果になっていて驚愕した。なんでこんなことが起こるんだろうか。常識から考えると全く理解できない結果なんだけども、シグナルはエライクリアー。この遺伝子のupregulationが一般的に意味するものと、実際のmorphological phenotypeが完全に逆になっている。実はこの遺伝子のoverexpression cloneもつい最近見ていたので、今朝もう一度そのサンプルの細胞達を一つずつ食い入るように見ていたら、ある部位特異的にだけども確かにmorphological phenotypeが逆になっている細胞をいくつか見つけた。うーむ、これがもし本当ならこの細胞達は何か結構重要なものを見せてくれているのだが。。。

まぁなんにせよ今は謎なので、この実験結果は今書いてる論文に含めることはできないことだけは確実。ということで、あともう一つは明日のお楽しみ。

あと二つ

現在進行中の実験の中から重要なデータになり得る実験をあと二つだけやり終えた時点で、とりあえず一度論文原稿を完成させて投稿してしまおうと決心。実験のアイデアはいくらでも出てくるので、このままやり続けていたらいつまでたっても終わらん気がしてきた。まぁいつもこんな感じで、もう少しと思ってやったらやっぱり面白いのが出て、よっしゃさらにもう一つと思ったらアレレ？というのが出て、というのを繰り返してしまう訳で、こういうのはあんまりエエ傾向ではないなと。で、今日その二つのうち一つの実験のサンプルが出来上がったのだが、これまたなんやらはっきりとしない感じ。抗体はちゃんとワークしてるはずなんやけどなぁ。明日コンフォーカルでもう少し見てみるけどあんまり期待はできない。まぁもしこれがネガチブなら、二ヶ月前にエエ感じでほとんど書き上げた原稿の構成をちょっと変えて話の重心をずらさなあかんね。

Backyard roller coaster

うちのバックヤードに設置した子供用のローラーコースター。

緊迫感

このところずっと月曜日の朝のミーティングはボスと二人だけでしていたのだが、今週からドンちゃんも加わって三人でやることになったのだそうだ。二人のプロジェクトでリンクしている部分があるし、ドンちゃんが学ぶことも多いだろうからということ。えぇぇ二人だけの方がエエんやけどなぁ、という予感が的中。自分がボスと話している間はいつも通りだったのだが、次にドンちゃんが発表し始めてからエライボスの機嫌が悪くなった。ボスがイライラしてデスカッションが緊迫するのなんて久しぶり。このラボに来た頃はグループミーティングでこういうことはしょっちゅうあって勘弁してくれと思っていたけど、久しぶりに見てみるとこういう緊迫感溢れるデスカッションもエキサイティングでなかなか楽しいかも。最近ボスとの二人だけのデスカッションでは緊迫感などまるでないただの雑談みたいになっていたから、ドンちゃんのあの人をイライラさせるしゃべり方によってもたらされる緊張から何かが生まれるだろうか。とか思ってみたけど、やっぱりリラックスしてデスカッションした方がエエアイデアが生まれそうな気がするなぁ。

Easter egg hunt 2012

昨日はイースターということで、例年通り朝から近所の家族が集まって各々の家をまわりながら子供達はエッグハント。

ウチは今まで家の前の庭でしていたのだけども、最近バックヤードもだいぶ子供向けに整備しつつあるので今年はバックヤードで。

そして最後はいつものように、三軒隣のアニカの家でパーティ。つい最近近所に引っ越されてきた奥さんが日本人の御家族も新たに加わって今年から七家族になったけども、いつも通りこの近所の家族との集まりは心が安らぐ。

脆弱性

最近、Flashbackというコンピューターウイルスが流行っているそうですね。最初に発見されたのはもう半年ほども前のようですが、先日のニュースによると、現在感染は拡大していて６０万台以上のMacが感染しておりその大部分がアメリカだということでした。ということで今日、大学の方からこれに対するいくつかの対策情報が送られてきた。まずは、このFlashbackがターゲットにしているJavaの脆弱性に対するセキュリティパッチをAppleがアップデートしたので、とりあえずそれをインストールして一応予防しましょうと。でももしかしたらもうすでに自分のMacが感染しているかも知れない、ということでそのチェックができるスクリプトをダウンロードしてチェックしてみましょうと。チェックしてみたら、幸い自分のマックは感染していないようだった。ちなみにこのスクリプトはCNNのウェブサイトからダウンロードできます。

で、どうでもエエことなんやけど、この「脆弱性」という言葉。自分はなんとなく頭の中で「きじゃくせい」と読んでいたようで、今この文章を書こうとしたらうまく変換されないのでこれはおかしいと思って調べてみたら「ぜいじゃくせい」なんですね。言われてみりゃ、あぁそうか、という感じやけども。

H3 C.S.

Columbia Crest Horse Heaven Hills Cabernet Sauvignon 2009

これまた素晴らしいCabernet Sauvignonですな。と言ってもCabernet Sauvignonが88%で、Cabernet Franc (7%) と a kiss of Syrah (3%) and Malbec (2%) が隠し味として入っているんだと。甘い花の香り。オレンジのような味。まろやかなタンニンにフィニッシュはカカオの風味。こんな旨いワインなのに１０ドルちょい。これは他の“H３”も試さなあかんねぇ。

ウジ虫のオスとメス

さて、皆さんはウジ虫のオスとメスを見分けられますか？まぁ普通の人はそんなことしようとも思わないのはよく分かっているけど。今まで幼虫期のマーカーと言えば、TM6BのTubbyとかfluorescent balancerとかを使ってきたけども、そういや今まで幼虫のオスとメスを見分けようとしたことがないことに気が付いた。というか、今やっている実験でその必要が出てきた。しやけどよう見てみたら意外と簡単なんやね。サナギのオスとメスを見分けるのは昔やったことがあったような気がするけど、同じ方法で幼虫も見分けることができる。つまり、幼虫の体の大体中央からもうちょっとオシリよりのdorsal側にgonadが一対あり、オスのgonadはメスよりも大きい。このgonadは透明な組織なんだけども、健康な個体ならこの辺りはfat bodyに覆われているので、オスを背中側から見ると白いfat bodyの間に丸い透明のgonadが一対見える（というか透明なので何もない丸い穴のように見える）。ところがメスのgonadは小さいのでこの丸い穴のように見える部分がないのだ。

へえぇ、と思われるかも知れないが、こんなことはflypusherの間では常識なのだ、たぶん。自分は知らんかったんやけどね。

たぶん近い

昨日の午後と今日の午前中、先週解剖している時にこれはキテルかもと思ったサンプル達をコンフォーカル解析。うーむ、すごいクリアーという訳ではないけどもかなり自分の思っているモノに近い気がする。ということでもう一回同じクロスの準備開始。まぁ今回はRNAiによるknockdown backgroundなんだけども、次はnull mutant backgroundでもっとクリアーな結果が出るかどうか、というところにかかってくるかな。先週中国のラボに注文したmutant flyがはるばる海を渡って来るのを楽しみに待っていよう。

Privada

Bodega Norton Privada 2008

アルゼンチンのBodega Norton２本目。Malbec 40%,、Merlot 30%、Cabernet Sauvignon 30%のブレンド。この「Privada」という名前は、元々このワイナリーの家族がこのブレンドをfamily's private reserveとしてごく親しい友人だけと楽しんでいたワイン、というところから来ているんだそうな。芳醇で甘い香り。一口飲んでこれはウマイと思った。マルベック、メルロー、カベルネの三種が素晴らしくまろやかに調和していて余韻はスパイシー。これ１８ドルくらいだっけな。ものすごええ感じやねぇ。

不思議やわ

またもや自分の守備範囲に入る論文のレビューがうちのボスに回ってきて、ボスが「興味あるなら読んでみたら」とか言いながらメールで送ってきたのが先週だったか。別にちゃんとしたコメントを書いてねって言われた訳ではなかったので、さらっと読んで「フェノタイプはなかなかオモシロイね」とか今日しゃべってたら、どうやらちゃんとしたレビューコメントが欲しそうだったので、今日の昼は食堂でランチを取りながらその論文を読んでその後コメントを書く。こんな人の論文のレビューしている暇があったら自分の論文を書きたいんやけど、とか思いながら読んでいたら、なんともお粗末な英語で結構適当なこと書いてやがるのがいちいち腹立ってきた。なんなんやろねぇ、もうちょっとちゃんと書いて間違いとかチェックしてから投稿しようと思わへんのが不思議やわ。

松本さん

昨日、友人の松本さんが少し前に亡くなられたことを松本さんの奥様からのメールで知った。
松本さんはもう十年ほど前、自分が会社で勤めていた時に一番仲良くしていた嘱託のおじいちゃんの一人だった。嘱託のおじいちゃんといってもその前は、ある化学系大企業の研究所で第一線の研究をされていた方なので、友人と言うにはおこがましい、社会人としても研究者としても大先輩にあたる方だったのだが、本当に気さくで愉快な方だったので会社ではよく二人でふざけあっていたことを思い出す。実は自分が会社を辞めて大学院に戻ろうと思っていたことを辞表提出前に会社の中で相談したのは信頼できる大先輩であると同時に仲の良い友人であった松本さんだけだった。相談した時に「それは素晴らしい、すぐにでも戻りなさい。」と強く後押ししてくれた彼の言葉がなかったら今の自分はなかったかも知れない。大学院への復帰が決まった時には会社帰りに二人で飲みに行ったし、三年後の春に博士号取得が決まった時にもわざわざ必要のない札幌出張を作ってまだ雪深い札幌にまでお祝いしに来てくれたのだった。アメリカに来てからはあまり連絡を取っていなかったのだが、去年末の一時帰国の際にひょんなことから会社時代のもう一人の親友、山本さんの取り計らいで京都で三人で会えることになったのだった。このときタイミングよく三人で会えたことは、奥様の言葉をお借りすると「まるで神様が下さった不思議な時間の様な気がしてならない」のである。京都で別れ際に「次の帰国の際にもまた必ず会いましょう。」と言ってしっかり握手をしたのが今生の別れとなってしまった。癌を患われていたのではあるけど、本人自らその作用機序を熱心に説明して下さった抗がん剤がうまく効いているようでお元気そうだったし本人も希望を持たれている様子だったので、こんなに早くという驚きが大きいとともに残念でならない。

今は楽しかった会話が一つ一つ思い出されてなんだかなかなか元気が出ないのではあるけど、研究の道へと自分の背中を押してくれた松本さんの激励に報いるためにもがんばって研究して成果を報告しなければと思う。

Springtime Parade 2012

一昨日土曜日は、Springtime Tallahasseeのパレードに参加。日本人コミュニティがタラハシーのAsian Coalitionの一員として毎年参加しているこの町の結構大規模なパレード。去年は御神輿をかついでパレードに参加したのだが、今回はパレード開始前あいにくの雨模様だったために御神輿なしでの参加になった。それでも子供達を引き連れて町のメインストリートを２kmほども歩くのはなかなか大変だったけども、沿道からたくさんの市民の方々が手を振ってくれる中歩くのはなかなか貴重な体験です。

二回目のBirthday Party

一昨日、ソウシロの日本人のお友達を招いて家でバースデーパーティが行われた。自分はもちろん仕事で家にいなかったのだけども。

アンパンマンケーキに、

手作りのバイキンマンピニャータ。

ソウシロのバースデーパーティは、先月近所のアメリカ人家族を招いて一度したのだけども、またもう一度お祝いしてもらって御満悦だった様子。

予想通りかも

今日のラボミーティングはモハメドの研究発表だった。あぁ、だから昨日一緒に顕微鏡を見て欲しかったのね。トルコから来たモハメドはまだ英語をしゃべるのがしんどそうなんだけども、今日のプレゼンは前よりだいぶマシになったように感じた。自分がモハメドにあげたプロジェクトは非常にシンプルなもので、今日彼が話していた基本的な実験結果はなかなかイイ感じ。うまく発展していくんじゃなかろうかと期待。

さて、このところSSTプロジェクトをさらにもう一段階深めるための実験をやり始めたのだが、実体顕微鏡下で見ている限りどうやら予想通りの結果が出ているように見える。もちろんコイツらを染色してコンフォーカルで実際の細胞達の挙動を確認してみないとなんとも言えないのだけども、これはエキサイティング。でもあんまり期待しすぎたら勘違いだったときショックだから、冷静になって粛々と染色しようっと。

モハメドスクリーニング

モハメドが最近取れたサンプルを一緒に顕微鏡で見て欲しいというので、今日の午後二人で顕微鏡を覗いた。少し前に研究テーマを一つモハメドにあげた訳で、いくつかのサンプルはその実験の基本データだったのだが、それ以外にもスクリーニングのサンプルがあると言う。去年アリスンとレクシーがやっていたスクリーニングはその後にモハメドが５０ライン追加でやったのを最後にして今一旦中断していると思い込んでいたのだが、どうやらモハメドはさらに続けてくれていたようだ。で、そのスクリーニングでヒットしたっぽいものを解剖したのだと言うのでそれも一通り見てみたのだが、なかなかイイ感じものがいくらかあった。いくつか既存の遺伝子が引っかかっている中で、一つ聞き覚えのない名前で結構強いフェノタイプが出ているものがあったので早速FlyBaseで調べてみると、去年のスクリーニングでアリスンが当てた二つの遺伝子と同じタイプの遺伝子。これはもう偶然とは言えなくなってきた。FlyBaseで同じタームで検索して引っかかってくる遺伝子は４０ほど。これはイってみるべきかも知れんなぁ。

Tax Return 2011

このところいよいよ真夏のような天気になってきたことに加えて、先週一週間子供の学校がスプリングブレイクで休みだったからか、なんとなく夏休みのような雰囲気だ。そんな中、早うfigureを作成して論文を完成させたいのだけども、なんやかんやとそれ以外にもやらなきゃいかんことがある。まず気になっているtax return（確定申告）をやってしまいたい。今年の提出期限は４月１７日。ということで今日は一日中パソコンに向かってコンフォーカル画像の解析をしつつ、tax returnにも取り組む。例年通りTurboTaxにガイドしてもらいながらなんやかんやと調べたりしてなんとか一通りやり終えたけども、やっぱりなんかよく分からん部分があるなぁ。たぶんこれで合っていると思うんやけど。。。

Maso Canali

Maso Canali Trentino Pinot Grigio 2010

先週のニックの結婚式で飲んだ白ワインはPinot Grigioだった。どこのものかは分からなかったけどこれがなかなかうまかったので、この週末コスコに行った時に赤以外にこのイタリアのピノグリジオをゲットしてきた。１０ドルほどだったかな。ちなみにこのMaso CanaliというところはPinot Grigioだけを作っているようだ。つまりPinot Grigioに最適なテロワールということなのか。この週末、真夏のような炎天下のバックヤードで庭仕事をしたからか、夜にすごく喉が渇いたので仕事をしながら一人でこのワインを開けてみた。コクがあるたくさんのフルーツの風味にさわやかな酸味。うまい。ピノグリジオというのはイタリアの白ワイン用の品種なのだけども灰色を帯びた紫色の果皮を持つんだそうだ。だからぱっと見た目は普通の白だけど光に透かすとうっすらとピンク色の光が見えるんですね。暑い夜にこうして冷やして飲むと最高ですな。いろんな料理にも合いそう。

時をかける少女

少し前に友達の日本人の方がアトランタの日本映画専門格安DVD店を通して子供用アニメを共同購入してくれることになったので、その時注文票に家になかったジブリアニメとかドラえもんの映画とか懐かしいやつをいくつか選んでおいたのだけど、その中に２００６年の「時をかける少女」を見つけたのでチェックしておいた。それで最近ドラえもんの映画を子供と一緒によく見ていたのだが、先日は子供が寝た後に一人で「時をかける少女」をゆっくりと鑑賞した。原作は言わずと知れた筒井康隆の同名小説「時をかける少女」。と言っても今までに何度もなされてきた原作の映画化ではなく原作の約２０年後を舞台にした続編。監督は細田守。この映画、スゴイ。めっちゃおもしろい上に感動した。しかも見終わった後に色々と考えていると、あぁもしかしてそういうことなのかって気付いてまた感動してしまったり。自分にとっては自分の十代の頃の追憶に加えて、緻密に描かれた美しい背景が日本への郷愁もかき立てるのだけども、こんなに楽しくて切なくてもう一度見たいと思えるような映画に出会えたのは久しぶりじゃないかなぁ。

Cell Picture Show

最近「Cell」がオンラインで「Cell Picture Show」という顕微鏡画像の展示を行っているのを御存知でしょうか。定期的に特集するテーマに沿って投稿されたものの中から１０枚ほどの写真を選んで掲載しているようで、毎回なかなかカッコイイ細胞の写真や動画が掲載されているんですね。で、実は二週間ほど前に、次回のテーマは「Cancer」で現在写真を募集中という告知をFacebook上で見て、おぉっと思った訳です。そこで一つ、ナイスなtumorous imaginal discの写真をエディターに送っておいたら、なんと昨晩エディターから「あなたの写真を採用しますよ」とのメールが来ていてびっくり。まさか選ばれるとはあんまり予想していなかったので写真のキャプションも適当にささっと書いたのだが、なかなかカッコよく編集してくれてあった。で、今日から公開予定というので昨晩急いでキャプションを校正したのでした。「Knudson Hypothesis」ですわ。この「Cell Picture Show」は毎回結構楽しみにしていたので、自分の写真が掲載されるなんてこれはかなりウレシィぞ。ということで、御覧になってみて下さい。

entail

entail：〜を伴う、必要とする、引き起こす

entail adverse side effects：副作用を伴う

例文

Genetically induced regeneration entails compartment-specific proliferation.

ニックの結婚式

昨日日曜日はニックの結婚式だった。ソウシロはまだちょっと難しいだろうということで、午後からロウチビと二人で隣町のMonticelloへ出かけた。この小さな隣町のはずれにあるWillow Pond Plantationという場所がニックの結婚式の会場。静かな森の中にあるきれいな場所だった。結婚式に出席したのはいつぶりだろう。アメリカで結婚式に出席するのは初めてだったからちょっとわくわくしながらの参加。ロウチビも興味津々だったようで、逐一いろいろと説明してあげるとびっくりしたり納得したりしながら初めてのアメリカンウェディングパーティを楽しんでいたようだ。パーティの途中で少しの間、ニックと二人だけで話す機会があった。半年ほど前にうちのラボを飛び出していったのだったが、移動先のラボで最近ようやくまたエキサイティングなプロジェクトを見つけることが出来たんだと話してくれたニックは幸せいっぱいな様子だった。よかったなぁ。

思い出せない遺伝子名

昨晩、また論文のレビューが回ってきたのでさっとその原稿に目を通してみたら、今自分が書いている論文とそっくりな論文だったので青くなってボスに相談する、という夢を見てしまった。。。早く投稿してしまいたいと思って先週とかかなり根を詰めてコンフォーカルしたりしていたのは確かだけども、意外となんか焦ってんのかなぁ。それにしてもこの夢の中でその論文原稿を見たときに、「こんなものは夢に違いない。」と思って自分で自分のほっぺたを思い切りつねってみるというマンガみたいな場面があった。でもやっぱりどれだけつねってみても痛くも何ともなかったので「あぁ、やっぱり夢か。。。」と思って、今度は現実とは違うなんかおかしなところがないか周りのラボの様子を見渡したりしてみるのだが、見れば見るほど現実にしか見えなくて「うわ、これはやっぱり夢じゃないかも。ヤバイ。」とか思ってさらにその論文を読んだりしていたのだけど、目が覚めてからその場面を思い出してみたら見たこともない場所だった。見たこともない場所なのに、現実とは違うおかしなところを探してそれが見抜けなかった、ってどういうことなんかな。脳ってヘンですなぁ。
ちなみにその夢の中で見た論文は、自分が調べているのとは違う遺伝子を使ってfollicleに同じようなフェノタイプを作り出していたのだ。あぁこれはやられたなぁ、でもオモシロイぞ、と思ったのだが、どうしてもその遺伝子が何だったのか思い出せない。。。

夏到来

今日の昼間は少しバックヤードの手入れ。ファイヤアントの蟻塚を壊したり、もうすぐ届く子供用の小さなローラーコースターを置く場所にちょっと土を盛ったりとかしているうちに汗だくのふらふらになってしまったのでビールを一本。その横で子供達は楽しそうにプールで遊んでいる。いよいよ夏到来という感じ。

Crime Bulletin

ここFSUではだいたい二週間に一回くらいの割合で「Crime Bulletin」（犯罪速報）というメールが大学当局から送られてくる。つまり、二週間に一回くらいキャンパスの近辺で学生が犯罪に遭遇しているということになる。

例えば今朝送られてきたのはこれ。

On March 14, 2012 at about 11:00pm, an armed robbery occurred near the Leach Center east parking lot, close to the ROTC Building on the west side of the main FSU campus.  A female was walking when she noticed a white car pass her, and the passenger point at her.  She kept walking, turned around, and noticed the passenger had exited the car and was approaching with what appeared to be a handgun.  The suspect demanded the victim’s belongings.  The victim complied and the suspect was last seen fleeing the scene in the vehicle.  Police did an immediate search of the area, but the suspects had already fled.  The victim was not physically injured.

つまり、昨晩１１時頃に大学構内を歩いていた女子学生に車から出てきた男が銃を突きつけて身ぐるみはがしたと。犯人は逃げて行方が分からないので気をつけましょうね。ということですな。ちなみに犯人が捕まったということはまず聞いたことがない。たいがいがこの、夜中に一人で歩いていた学生がrobbery（強盗）に遭うというパターンなので、あぁまたか、夜ラボに来る時は気をつけんとあかんな、くらいにしか思わないのだが、今日の午後に来た速報はいつものとは違ってなんやら緊急性が高い感じだった。

The Florida State University Police Department is responding to a reported double stabbing at Regans Hall #1.  At this time, it is assumed that the responsible parties are the victims.  There is no report of an assailant at large at this time.  Regardless, all persons in the area should use caution and avoid the Regans Hall Complex.  Numerous emergency vehicles are responding or are on scene.

大学構内で殺傷事件が発生したようなのでそこから避難するように、と。まぁ午後はずっとコンフォーカルしとったから知らんかったんやけどもね、怖いーゆーねん。二日連続やし、しかも今日のは昼間にstabbingて。FSUはアメリカでも結構治安が悪い方なのかなぁ、たぶん。ダートマスにいた時にはこんな事件は一回も聞いたことがなかった。まぁ、あそこはあそこで特別治安がエエ地域やったんやけど。

脱出

上皮細胞層から抜け出して手足を伸ばして歩き始めた細胞。どこに行こうとしとんのかねぇ。

Bodegas Ateca Atteca

Bodegas Ateca Atteca Old Vines 2009

町の北の方にある酒屋にふらっと立ち寄った時に、カッコイイラベルに惹かれて持って帰ってきたワイン。１５ドルくらいだったはず。スペインのCalatayudというところで作られている、樹齢１００年ほどの古木から収穫されたガルナッチャ１００％のワイン。上品な口当たりで色んなフルーツの味がするかわいらしいお酒という感じなんだけども、酸味たっぷりの余韻は深い。一口飲むごとにぽわーっとなりますなぁ。これは旨い。

土産話

頼まれていたもう一本のレビューの締め切りが先週の水曜日であることをその前日に知らされて、おいおいちょっと待ってくれや、と思いながら結局金曜日にその論文原稿を精読して土曜日にようやくボスにコメントを送付。なかなかシブイんやけど、ちょっとラフ過ぎる感じ。とまぁそんなことはどうでもよくて、気になっていたのは先週あったFly Meetingの様子。今朝ボスに色々と土産話を聞かせてもらった。とりあえずアブストラクトにあった、今自分が書いている論文とちょっと似ているかもしれない発表については、それほど心配するような状況ではないだろうとのことで一安心。ワークショップでのトークもたくさん質問が出てなかなかイイ感じだったそうな。まぁいろいろと今書いている論文に対するアイデアを持ち帰ってきてくれた訳だけども、とりあえずは今の形で早々にサブミットしてレスポンスが返ってくるまでの間にもう少し実験をしていきまひょかということになった。さて、今週は明日から三日連続でFigure用写真を撮るためのコンフォーカル。

日曜の午後

本当に絵を描くのが好きなロウチビ。

Bodega Norton

Bodega Norton Reserva Malbec 2008

久しぶりのマルベック。マルベックと言えばアルゼンチンですな。こないだ日本に帰国した時、友人のFAに連れて行ってもらった六本木のもつ鍋屋でもつ鍋と合わせてみたAlamosのMalbecがことのほか旨かったことを思い出して、こないだコスコに行った時に手に取ったのがこちら。マルベックってやっぱり濃いのが多いねぇ。これはちょっとアルコールの匂いが鼻につくのだけども、１４ドルほどのワインとは思えないスケールの大きさを感じるような味わい。やっぱり肉料理と、かな。

Fiji

「Fiji」っていうのは「Fiji Is Just ImageJ」なのである。

Fiji is an image processing package.  It can be described as a distribution of ImageJ (and soon ImageJ2) together with Java, Java 3D and a lot of plugins organized into a coherent menu structure.  For users, Fiji is easy to install and has an automatic update function, bundles a lot of plugins and offers comprehensive documentation.

だからまぁ、基本的にはImageJと同じなんだけども、Fijiには始めからたくさんのプラグインがメニューの中に整理されているし、何かアップデートがあればそれを知らせてくれる。なるほど、じゃあもうFijiにしよう、とか思って今まで使ったことのないプラグインをいじってみたりしていたのだが、今使っている「Volumest」が入っていなかった。でもこういう時にプラグインを追加するのも簡単。ダウンロードした「.jar」ファイルをFijiのウィンドウにドラッグ＆ドロップするだけ。おぉこりゃイイぞ、とか思ってもやっぱりこれは名前の通り、いつも使っているImageJなんやね。

A lazy afternoon

ガレージのジープ

昨日のフィネガンのバースデーパーティで、さぁそろそろみんな帰りましょうかという時にガレージでこのジープを発見したソウシロ。本当の車と同じように、アクセルを踏むと走るようにできているこのジープが楽しくてたまらない。

六週目

この土日は、土曜日が近所のジムナスティクスの教室でアニカのバースデーパーティ、そして昨日日曜日はソウシロの友達、フィネガンのバースデーパーティだった。１月末から６週末連続のバースデーパーティで、ついに今週末のマックスのバースデーパーティで７週末連続の今春のバースデーパーティシーズンがようやく終息する。昨日のフィネガンのバースデーパーティではロウチビがプレスクールで同じクラスだったフィネガンのお兄さん、リアムと庭で散々サッカーをして遊んであげたおかげでちょっと体は疲れ気味。

今週はほぼ出揃ったfollicleの実験結果をひたすらquantificationして、来週集中的にコンフォーカルで論文掲載用の写真を撮ったら論文原稿は完成する予定。で、今週開催されるFly Meetingのアブストラクトをチェックしていたら、今自分が書いている論文とちょっと似ているかもしれない発表があったので、こちらはボスが探りを入れてくることになった。さぁ、どうなることやら。

春のストック更新

業務連絡。全ストック更新完了。

今春の学会

今日からもう三月ですか。フロリダはいよいよ夏が近づいてきている感じで、大学のキャンパスを歩いている大学生はもうみんな真夏の格好だ。世の“fly pusher”の皆さん方はそろそろシカゴに行く準備をされている頃でしょうか。Fly Meetingは毎年行くようにしようと思っていたのだが、今年は５月にドイツで行われる小さな学会にどうしても行ってみたくなったので、来週のFly Meeting in Chicagoはパスすることにした。しかしながら今回のFly Meetingでは三日目金曜日のワークショップ、「Apoptosis, Autophagy and Other Cell Death Mechanisms」からのお誘いをもらったので、今執筆中のfollicle論文の内容の一部をボスが話しにいく予定。そういやこのトークの内容についてボスと話さないかんな。要旨集を見ているとだんだんシカゴへ行きたい気持ちが膨らんできてしまったので、それを紛らわすためにそろそろドイツ行きのチケットを探そうっと。

上下逆さまにして

ここのとこなんやら風邪が長引いててあんまり調子が良くないのもあって、結局昨日の予定だったゼミは自分の予定通り今日にしてもらうことにした。まぁ一日延ばしたところで風邪が急に良くなる訳でもなく、今日の発表は咳が出たりしてちょっとしんどかったのだけど。で、このゼミで発表する論文を読んでいる間に気付いたのだが、この論文を発表したラボから新しく投稿されている今レビュー中の論文原稿には、この一年前に発表された論文の中で既に公表されているのと同じデータが結構あるのだ。しかも一つのfigureなんて、全く同じ写真の向きを上下逆さまにして順序を入れ替えて新しい論文原稿に使い回しているのを発見してしまった。こういうのってちょっと印象悪いよなぁ、ていうか二重投稿と言われても文句言われへんのとちゃうかなぁ。とまぁそんなことを発見してしまったせいもあって、発表にあんまり力が入らなかったのでした。

明日かいな

先週ボスに二本の論文のレビューを手伝って欲しいと頼まれたので、今その二本の論文を読んでいるのだけども、ふと気付くと今週のジャーナルクラブは自分の発表の番らしい。ちょうどそのレビューしなければいけない論文の元になっている同じラボから去年報告された論文を読まなきゃいかんと思っていたところだったので、こちらをさっと読んで明後日のゼミで発表したろうとか思ったら、ゼミは明日なんだそうだ。うー、いつの間に日程を変えたのか。まぁ今から準備すれば明日の昼までにはなんとかなるかもしれんけど、ややこしいのでコロコロとゼミの日程を変えるなっちゅーねんゆー話やでこれが。

さて、今朝のボスとのミーティングでSSTのほうもなるべく早く投稿しようぜ、という話になった。というのもつい最近、ヒトの培養細胞を使ったちょっと似たような話（といっても話の軸となる発見は全く違うのだが）の論文が公表されたから。まぁfollicleの実験はほぼほぼ終了に近づいてきたのでこれは望むところ。ということでこちらもそろそろ書き始めるか。

hsFLP

ちょっと「hsFLP」について。いわゆるヒーショッフリップ（heat shock flipase）。正確には、FLP recombinase under the control of a heat shock-inducible Hsp70 promoter かな。ハエでmosaic analysisをしている人なら毎日当たり前のように使っていて、当然X chromosomeにのってるやん、とか思い込んでかけ合わせて次世代にヒートショックかけて解剖してみたらモザイク入ってなくて、うわぁコイツらhsFLP持ってないやんけっていうことがあるくらい。ってそんな人はおらんかな。自分は何回かやったことあるけど。さて、ここ最近随分とflip-out Gal4を使ってfollicleにいろんなタイプのoverexpression cloneを作り出しているのだが、どうもいくつかのクロスでflip-outが起こりすぎている、というかほぼ全ての細胞でflip-outが起こって組織全体がGFPで真っ緑になっているのである。heat shockは３７℃３０分。follicleでのflip-out cloneなら大体３０分のadult heat shockでイイ感じのモザイクが得られるはずなのだが（もちろんクローンの種類にもよるけど）、こんな風に全部の細胞でフリップアウトされると非常に困るのである。だってモザイクにしたいからflip-out cassetteを使っている訳で、全ての細胞で発現のタイミングだけコントロールしたいんやったらGal80ts使うっちゅーねんゆー話やでこれが。

実はある特定のhsFLPがfollicleでこの現象を示すことはもうだいぶ前から知っていたのだけれど、今回久しぶりに大事なとこでやられて悲しくなったのでした。まぁやられたと言っても以前にこのhsFLPをいくつかのUAS lineに仕組んでおいたのは自分なんやけど。

さて、Ashburnerの「Drosophila」によれば、過去に少なくとも３種類のhsFLP constructが作られているようだ。以下、各々のconstructに対する記述の一部を抜粋。

P{hsFLP} (Golic and Lindquist 1989)
In some chromosomal locations, this gene is highly inducible, e.g., the insertion P{hsFLP} l(2)2B[2B] on chromosome 2.  In other locations, it is inducible to a lower level, e.g., P{hsFLP}1 on the X chromosome.  Transgenes may also exhibit substantial constitutive expression, and this may vary from tissue to tissue.

P{70FLP} (Golic et al. 1997)
It typically shows significantly higher induced activity than P{hsFLP}.  P{70FLP} insertions also usually exhibit significant noninduced expression, at least in the eye.  Judging only from the size of resulting clones, most of this uninduced expression appears to occur early in development, either in embryos or in first-instar larvae.  One particular insertion of this construct, P{70FLP}10, exhibits constitutive activity in the soma and can be used to generate mosaics without the use of a heat shock.

P{hsp70-flp} (Struhl and Basler 1993)
This construct is also quite effective.

mitotic recombinationによるFLP-FRT mosaic cloneの場合のrecombination rateはFRTのサイトにも依存することはよく知られている事実だけども、flip-out cassetteにおけるcis-excisionの確率は、cassetteの種類やそのinsertion siteよりもhsFLPの種類による影響が大きい気がする。もちろん同じhsFLP constructでinsertion siteが違うことに起因する可能性もあるのだけど。そういえばある種のflip-out cassetteがfollicleに限らずモレモレなのも見たことがあるけど、あれはhsFLPのnoninduced expressionのせいなのか。

で、この記述だけを見ていると、普段使っているのはP{hsFLP}で、この真っ緑のfollicleを作ってくれるハエは代わりにP{70FLP}を持ってんのかなぁという気がする。まぁいずれにしてもhsFLPを変えてやり直さなあかんかも。。。

Kendall Jackson Chardonnay

Kendall Jackson Grand Reserve Chardonnay 2009

そしてもう一本は、Kendall Jacksonのシャルドネ。これもコスコで１５ドルちょいだった。柑橘系のさわやかな香りにクリーミーなコクのある味わい。非常に飲みやすい。これも好きやなぁ。

Markham Vineyards Merlot

Markham Vineyards Merlot 2008

そういや先週はコスコで買ってきたワインを二本も開けたんだった。こちらはNapa Valleyの老舗のメルロー。メルローにしては随分と若々しい力強さを感じる濃厚な味わい。コスコで１５ドルちょいだったかな。イイ。

Pillar Box Red（二本目）

Henry's Drive Pillar Box Red 2008

昨日は入籍７年目の記念日だったので、晩御飯を食べた後にPublixに行ってワインを買って来た。以前にも飲んだことのあるオーストラリアのPillar Box Red 2008。ついでに手に入れてきたアイルランドのDubliner Cheeseをつまみに二人で乾杯。いやぁ、このワインやっぱり旨いわー。なんとも言えないかぐわしい香りがします。

シーズン最終戦

先週の土曜日はロウチビが参加しているサッカーチームの今シーズン最後の試合の日だった。１２月から３ヶ月ほどのシーズンで、しかも最初の一ヶ月くらいは日本に帰国していて参加できなかったこともあって、本人は最初の頃あまり乗り気ではなかったのだけども、回を重ねるごとに少しずつ慣れてきて友達も出来たようだった。実はこの冬サッカーをやらせてみようと思ったのは、勝ち負けのあるチームスポーツを体験することで一つ精神的な強さを得ることにつながるのでは、と期待したから。

今まで練習のときは結構楽しそうにしていたのだけども、試合となるとちょっと尻込み気味のロウチビだったのだが、実はこの土曜日の試合で、今までで初めて自分から試合に出たいと手を挙げてグランドへ出て行ったのだった。そして初めて積極的にボールを蹴りにいっていた。試合後楽しそうにベンチに戻ってくる娘の姿を見て、あぁまた一つ成長したんだなぁと思った。この日が最後ということで、試合後は近くのピザ屋でチームのみんなが集まって打ち上げ。ここでチームの集合写真と一人一人に用意されていたメダルをもらって本当にうれしそうにしていた。でも同時にチームのみんなとの別れはさみしかったようで、来シーズンまでに練習してまた同じチームに参加するんだと意気込んでいたのでした。

Happy 2nd Birthday!