Widefield

ラボのセットアップをする上で、一番重要で且つ一番高い買い物になる設備が顕微鏡だ。以前、遺伝研にいた時に購入したNikonの蛍光顕微鏡はなんとかこちらに移動できればと思って、梱包してもらって送付手続きもしているのだけど、運送業者へ提出する書類がまだ難航中。本当はコンフォーカルを導入したいのだけど、今あるスタートアップだけでは価格的にちょっと厳しいので、それは今後グラントが獲得できた時に考えることになる。まぁ、コンフォーカルは一応共通機器にもあるし。ということで、最近ずっと新しい蛍光顕微鏡のことを考えていた。エピで高倍率レンズでもコンフォーカルに近い画像が得られて、z-stackとかタイムラプスとかもしっかりできて、学生達が手軽に使えるようにあまり難しい操作を要求しない、そしてコンパクトであまり場所を取らず暗室を必要としないもの、という感じだと、ベンチトップ型All-in-oneタイプのものが候補になってきた。具体的には、Keyence BZ-X、Evident APX100、Andor BC43、Invitrogen EVOS、ECHO Revolutionとか。こういうのって、箱の中にサンプルをセットしたら画像がモニターにパッと映って、もっと拡大してみたいところにワンクリックでサッと行けるとか、めっちゃ便利なんだろうけど、暗室で接眼レンズを覗いてひたすら観察している時の発見に興奮してきた自分としてはちょっと抵抗があったりする。と同時に、Gen Zの若い学生はこういうものの方がどんどん使ってくれるのではないかとも思う。そんな訳で、来週は月曜日にOlympusの人と面談して、金曜日はKeyenceがデモ機を持ってきてくれる。

夏

最近はもう夕方になるとキャンパスにはほとんど人がいない。天気も真夏のようになってきて、夏休みだなぁという感じ。この夏、NSFのグラントを申請しようと思っていたのだけど、昨日ChatGPTとディスカッションした末に、今回NSFは見送って他のことに集中することを決断した。

JP

先週、うちの学部の他のラボにいる２年目の大学院生JPから、そちらのラボでPhDをやらせてもらえないだろうか、というメールが来た。少し前からうちに来ることになったJMとかなり似たような状況。今うちのラボにいる大学院生はJMだけで、秋の新学期からイランの２人が入学することになっている。とはいえ、今の政府による移民とか大学に対する対応を見るにつけ、イランからの２人が夏の間にビザを取得できる可能性は低いのではないかという気がしてきた。実は彼ら以外にも、この春にうちの学部を卒業したアメリカ人の学生が２人、そして国内の他大学にいる留学生が２人、次の春からうちのラボに来ることを目指している。まぁ場所と資金の都合上、そんなにたくさん受け入れることはできないし、いずれも予定とか希望であって、イランの２人のビザが下りなかったら年末まで大学院生はJMだけということにもなりかねない。秋学期が始まると学部生が３人来る予定だけど、彼らは研究に集中できるわけではない。という色々な可能性を考えつつ、今週JPと面接をした結果、結局彼女を２人目の大学院生として受け入れることにした。JPはこちらの分野での研究は初めてだけど、これまで海洋生態学をやってきた学生ということもあり、がんの進展を進化生態学的な視点から見るという私の説明をすんなり理解していたので、意外とやっていけるのではないかと思ったのだった。ラボの移籍がスムーズにいけば、この夏からとりあえず彼女らと３人で研究をスタートできそうだ。

F and J

今日、国土安全保障省長官からハーバード大学へ出された通達文書。読んでみるとなんやらちょっと内容が稚拙なんだけど、国土安全保障省のTwitterアカウントが掲載しているものだから本物なのでしょう。先ほどコーヒータイムに集まっていた同期のファカルティ達との間で話題になった。危険分子とみなされる人達に関する情報を全て提出せよという政府からの要求に大学側が応じなければ、在学している外国人の全ての F- or J- nonimmigrant status を剥奪すると。ということは、全ての留学生と相当数のポスドクも含まれることになるか。

これは本当にショッキングなことで、ハーバードがこれにどう対応するのか注視したい。しかしこれって、イスラエルから来ている方々も含まれてしまうと思うんやけど、それはエエのかな。

10 inmates

なんかうちらがニューオリンズに行ってた木曜の夜、ニューオリンズのダウンタウンの近くにある刑務所から囚人が10人も脱獄したんだそうな。これまでに３人が捕まったらしいけど、まだ７人が逃走中。殺人犯やら強盗犯やらが含まれているということで、かなり危険。報道を見ていると、刑務所の警備や施設が相当ずさんだったようで、本当にダメだなぁという感じ。ちょっとゴールデンカムイを思い出した。

多様性が豊かで同調圧力の低い自由な雰囲気と社会の治安がトレードオフの関係にあるのは、ある程度仕方がないことなのかも知れないけど、やっぱり治安が悪いというのは困ったことよね。早く全員捕まりますように。

Commencement

昨日は朝から大学の卒業式ということで、町の一番大きなドーム会場で開催される式に出席してきた。アメリカでは卒業式のことを「Commencement（始まり）」というらしい。始まりだから入学式のことかと思っていた。ともあれ、このCommencementは大学の大切な行事なので教員は原則出席しないといけないらしい。そして、出席にあたってはドレスコードがあって、いわゆるAcademic Regalia（大学式服）を着て出席しなければいけませんという通達。アメリカの大学を卒業したことがない自分はもちろんそんなものを持っていなかったので、少し前から色々と調べてAmazonで探して、ガウンとフードと帽子という一揃いの３点セットを手に入れた。調べてみるとフードの色とか帽子の形とかなんやかんやと意味があり、基本的にはヨーロッパの中世のものに由来するようだが、アメリカ独自の様式があるらしい。卒業式は二日間に渡ってカレッジ別に行われていて、うちらはCollege of Sciencesとしてのもの。学部学生、修士課程、博士課程の全ての卒業生一人一人の表彰をステージ上で行うので、結構長い時間だったけど学生達の嬉しそうな表情を見るのは良い経験だった。

写真は、入場前のファカルティ待機室の様子。

Dr. TM

先週で期末試験も終わり、いろんな報告書とかレビューの類いも片付いてきたところで、今週は火水木と三日間、日本からTM博士がこちらを訪問してくれていた。水曜日にはうちの学部でセミナーをしてもらって、昨日木曜日はニューオーリンズへの日帰り旅行をしながら、ひたすら二人でディスカッションをしていた。TM博士は北大のYラボで数年間助教をしていて、自分とは入れ替わりだったので同時期にラボにいたことはないのだけど、同じラボにいた訳なのでその界隈に関する話は尽きない。ということで、お互いの研究の話から学生達の話、そしてこの研究分野に関わっている多くの研究者のことから日本の大学の問題点まで、本当に色々な話題について理解を深めることができて楽しかった。

swamped

日本からこちらに帰ってきて今日で９日目、ようやく時差ボケから回復したかな。今週は今学期のファイナルウィークということで、期末試験が行われている。自分が担当しているクラスでは、論文のレビューをするというtake-home examの課題を土曜日にオンラインで公開したので、今週は学生達がそのレポートを提出するのを待って採点をするだけ。ということで、日本の科研費の報告書（３本）、京大の学内ファンドの報告書、学生のフェローシップ申請書の添削、共同研究の論文の担当パートの執筆、ラボの機器注文のための事務手続き、アメリカのグラントのレビュー、などなどいくらでも湧いてくる事務仕事に浸っている。ちなみに、こちらではこういうのを「swamped」と言ったりする。swampというと、まさにこのルイジアナ南部の地域を覆う沼地のことなんだけど、沼にはまって身動き取れないような状態のことを表す比喩なんだろう。以前に同僚のメリッサが「I'm swamped by the panicking students!」とか言っているのを聞いて、なるほどそんな表現があるのか、なかなか上手いこと言うなぁと思ったのだった。

GMS.15

今日から早くも五月で春セメスターもそろそろ終わり。来週が期末試験なので、その試験を作らないといけない。そしてその前に今日が最後の授業ということになるので、期末試験の準備になるような授業を用意してやろうと思っていたのだけど、昨晩は時差ボケによる眠気がすごくて晩御飯を食べる前に寝てしまった。で、目覚めてみるとまだ午前１時過ぎ。そんな訳で、朝までに授業の準備は大体できたのだけど、これだとまた今日も夕方に眠くなるんだろうなぁ。まぁ仕方ないか。

試験は、これまでに学んだことを踏まえて取り組むようなレポートが良いかなと。中間試験では、架空の心疾患を研究するための遺伝学モデルを考えて実験計画を立てるというものにした。期末試験は、実際にbioRxivで公開されているプレプリントの論文に対するレビューを行うというものにする予定。なので今日の最後の授業では、論文のピアレビューとはどういうものなのか、レビュワーはどういう役割を果たすべきなのか、というようなことについて話そうと思う。

帰LFT

日曜日の午後に関空から出国して、サンフランシスコ、ヒューストンを経由して、こちらの日曜の夜遅くにラフィエットの家に帰宅。いつも通り、大体丸一日かかる感じ。フロリダにいた頃はアトランタが近かったので、アトランタがハブのDELTAを毎回使っていたのだけど、ここはヒューストンの方が近くて便利なので、最近はUNITEDを使っている。

関空ーサンフランシスコは10時間ほどのフライトなので、やっぱり西海岸はだいぶ日本に近いなという感覚。なのだが、今回の一時帰国でここルイジアナでの生活と日本が自分の中でなんとなくシームレスにつながっている感じを持った。以前アメリカに住んでいた頃は、日本への一時帰国は一年に一度あるかないかという頻度だったけど、今回は三ヶ月ちょいだったし、また数ヶ月後に行かなければとかいう事情がそう感じさせるのかな。まぁでも時差ボケだけはいかんともし難い。

Lab packing

一昨日の夜、大阪の実家に帰ってきた。京都ではやはりというべきか、会う予定だった人以外にも多くの方々と話す機会が持てた反面、意外とラボのパッキングをする時間がなかった。しかも、年末に京都のラボを出た時はまだ学生達が実験をしていたので、ほぼそのままの状態で出て行ったこともあり、ラボの整理とパッキングは実はこれからなのだということに気付いた。そんな訳で、また近いうちにもう一度来なあかんやんという話。今バイトとしてハエ達の継代維持とスクリーニングをやってくれている学生二人も６月末までの予定なので、そのあたりでもう一度来てやらないといけないか。まぁ、しゃーないね。

京都

土曜日の早朝にLafayetteを出て、ヒューストン、羽田を経由して日曜の夜に大阪の実家に到着。そして昨日の午後、無事京都に到着。今回は河原町丸太町近く、鴨川に面したホテルに投宿。部屋はゆったりした綺麗な和室で、大浴場があり、朝食も素晴らしく、一階のロビーから鴨川に出て散歩できる。我ながら良い宿を見つけたもんだ。昨晩は、Yさんと二人でYさん行きつけの焼鳥屋で乾杯。とても美味しい鳥料理の数々を頂いた。

今日から三日間は、皆さんとミーティングしつつ、ラボで色々と作業をしなければ。

GMS.9~14

そういえば授業内容について、８週目までこのブログで記録していたけど、Fly Meetingのあたりから忙しすぎて記録を怠っていたので、ここで簡単におさらいしておこう。

GMS.9：Genetic interaction, Epistasis, Modifiers

HypomorphとかAntimorphとかのterminologyの説明から始まり、ハエの複眼の赤色を作る２つのパスウェイ（PteridineとOmmochrome）におけるepistasisを紹介。そして、modifier screenの例として、ommatidium R7 cellの形成に関わるsevenlessのmutantがUVライトへの走性を失っている表現型を利用したdominant modifier screeningについて。

GMS.10：Review for mid-term exam

中間試験前にこれまでの授業の復習（San Diegoのホテルからリモート講義）

GMS.11：Targeted mutagenesis and genome editing I

Homologous recombinationとNon-homologous end-joining、マウスにおけるgene knockout、トランスジェニックマウスができるようになった歴史、そしてTamoxifen-induced CreER/loxPのシステムまで。

GMS.12：Targeted mutagenesis and genome editing II

CRISPR-Cas9について。1987年にCRISPR配列が発見されてから、それがファージに対するバクテリアの免疫システムであることが分かり、このシステムを利用したゲノム編集技術を開発したE. CharpentierとJ.A. Doudnaのノーベル賞の仕事まで。

GMS.13：Clonal analysis with genetic mosaics

まずはGynandromorphから。Drosophilaで発展してきた遺伝学的モザイク解析技術について。Gal4-UASとFLP-FRTの合わせ技、MARCMとかFlp-out Gal4システムまで話した。1970年代、FLP-FRTが開発される前、A. García-BellidoらがX線によってmitotic recombinationを誘導して、各種phenotypic markerを目印にモザイク解析をしていたのは本当にすごいなと思う。

GMS.14：Application of genetic analysis

Case study I: Cell competition and compensatory cell growth ということで、これまでに学んできた遺伝学実験手法が、実際の研究でどのように使われるのかを示す例として、自分のcell competitionとCCHに関する仕事を紹介。

こうして14週間の授業を振り返ってみると、これはなかなか素晴らしいコースになったのではないかと自画自賛したくなる。古典的なメンデルの遺伝学やモーガンの染色体説から始まり、X線によるmutagenesis、バランサー染色体、C. elegans、ハイデルベルグスクリーニング、トランスポゾンの発見、P-element、エンハンサートラップ、Gal4-UAS、RNAi、トランスジェニックマウス、相同組換え、CRISPR-Cas9、モザイク解析まで、生命科学の発展の基盤となった発見や遺伝学実験技術について歴史を追いながら見ていくことによって、体系的な知識を学ぶことができたのではないかと期待。少なくとも自分はこの辺りのことを今一度しっかり勉強できて良かった。まぁ、学生からの評価はまた追々。

Spring break!

うちの大学は今日からスプリングブレイク。来週は一週間休みで、再来週はもう一週授業があるのだけど期末試験前ということもあり、論文ディスカッションの授業を一回やるだけで、もう講義はしない予定。ということで、昨日の14週目の講義が、この春セメスターのコース「Genetic Model Systems」の最後の講義ということになる。まだ期末試験があるけど、これでほぼほぼ終わったということだ。三ヶ月前に始まった当初は、週２回の授業が15週とか、全く終わりが見えず、本当にやり切れるのかという不安がかなり大きかったし、毎週この準備に追われていた気がするけど、まぁ、なんとかなったな。達成感と解放感、そしていよいよ研究の方に戻れるという期待。

Active Shooter Plan

今日の午後、FSUでマスシューティングがあったようだ。ニュースを見たら、自分がよく知っているキャンパスでの惨劇が映し出されていた。今住んでいる町は結構平和な雰囲気だから忘れてしまうけど、この国は大学とか学校でこういうことが起こるんだということを久しぶりに思い出した。そういえば今のオフィスに引っ越してきた時、たぶん以前にこのオフィスを使っていた先生が貼ったのだろう、ドアの内側に「Active Shooter Plan」という張り紙があって、キャンパスで銃撃事件があった時の対処法が書かれていてハッとしたのだった。

Crawfish!

先週の金曜日は、Lagniappe Dayといううちの大学の大きなイベントだった。メインはcrawfish boil、つまり皆んなでボイルしたザリガニを食べるイベント。ザリガニはこの時期のルイジアナの名物料理で、ケイジャンのスパイシーな味付けがされた山盛りの真っ赤なザリガニの写真をよく見ていたので、いよいよ初体験ということでちょっと楽しみにしていた。ということで、昼にキャンパス内で料理されたザリガニをもらったのだけど、大きな袋にまぁものすごい量のザリガニ、多分100匹くらい入っているものをもらった。これが一人分というのだからすごい。大きな木の下に腰掛けてひたすら皮を剥いて尻尾の部分の身を食べた。ザリガニは、日本の池とか田んぼで見るまさにあのアメリカザリガニなんだけど、この辺りの広大なスワンプで養殖されているのだそう。そして翌日土曜日には、スーザンに誘われてクロウフィッシュホームパーティに参加。同じファカルティのAとSも来ていて、４人でこれまた山盛りのザリガニを食べた。そんな感じで今ルイジアナはザリガニの季節真っ盛り。そして今日4月17日は、National Crawfish Dayなんだそうな。

JM

数日前に、うちのBiology Departmentの大学院生JMからメールが来て、うちのラボの研究に興味があって、あなたのラボでPhDのための研究をさせて欲しいという。CVを見てみたら、大学院に入学して三年目で、これまではDr. FVのラボで培養細胞を使って抗がん剤の研究をしていたのだけど、今は他のラボを探しているんだとか。まぁ一度話してみるか、と思って昨日面接をしたところ、今まで所属していたラボは隣町New Iberiaの研究所にあるのだけど、授業やTAはLafayetteのメインキャンパスだから、行き来が大変だったんだそうな。あと、近々Dr. FVが違う大学に移籍するということも聞いていたので、多分それも他を探している理由の一つなんだろうなと理解。結構しっかりしている感じだったし、やる気もありそうだし、うちはまだたまに来るだけの学部生が二人いるだけで人手は欲しいので、とりあえず受け入れて様子を見てみるかということになった。

のだが、その面接の後、新人教員達で集まってコーヒーを飲みに行った時にその話をしたら、New Iberiaの研究所に出入りしている I が顔を曇らせて、その学生はちょっと問題があったっていう話を聞いているよと。どうやらあんまり実験をしないからDr. FVとうまくいっていなかったんだとか。あぁ、先に I に聞いておけば良かったなぁと思ってももう遅い。そんな訳で、その学生はただDr. FVと合わなかったということなのかも知れないしねぇ、とか皆んなに慰められつつ、たぶん学生の指導ということに関して自分は彼らよりもだいぶ大変な思いをしてきている気がするし、まぁちょっとトライしてみるわとということになった。

NOLA

今週月曜日は、こちらに赴任して初めてNew OrleansのWMラボを訪問してきた。前に訪問したのは一昨年の夏だから二年ぶりのはずだけど、あの時結構長居させてもらったし、ほとんどのラボメンバーをよく知っているので馴染みの場所という感じ。今回は、うちのラボのセットアップにあたって、どういうものを導入するか検討するために今一度色々と見せてもらいがてら、WMや他のラボメンバーと研究の話をさせてもらった。LafayetteからNew Orleansまでは車で２時間半くらいなので、今後共同研究とかで互いのラボを学生が行き来することも可能だよねという話になった。

そんなわけで、ラボのセットアップのために購入する設備や備品はだいぶ固まってきたのだけど、ラボの改修に関する学内の手続きは遅々として進まない。もう自分の中ではそろそろ諦めつつあって、改修は後回しで新しい設備を導入してハエ達を日本から連れて来て、来月には実験を開始させようと考えている。ということで、次考えないといけないのはハエ達の輸入に当たっての手続きか。

スーザン

なんか、先週は本当に忙しかった。と言ってもまだその忙しさは続いていて、明日は講義があるし、金曜日は「Fly Bayou」でのトークがある。先週とくに忙しかったのは、学部生のためのアドバイジングがあったから。自分が担当することになった４人の学生一人一人と、これまでの履修状況を確認して次の秋学期にどのような授業を取れば良いのかを話し合って決めるのだが、各々学年も違えばレベルもまちまちなのでなかなか難しい。そもそもまずは自分がこの大学の単位履修のシステムをしっかり理解していないとアドバイスできないのだけど、アメリカの大学を卒業していない自分にとってはシステムが複雑すぎて何がなんやらよく分からない状況だった。そんな訳でかなり困っていたのだけど、たまたま同じフロアにいるスーザン（たぶんこの学部の最年長）と廊下ですれ違った時に話してみたところ、自分が担当している学生一人一人の情報を一緒に見ながら指導の仕方を丁寧に教えてくれた。具体的に一人一人のケースについて教えてもらったことで、ようやくどうすれば良いのかが分かって、一応アドバイジングをつつがなく終えることができた。もう本当にスーザンに感謝。「Don't be bashful and ask any questions!」と言ってウインクするおばあちゃんがとても頼もしく見えた。そんなわけで、今週土曜日にスーザンの自宅で開かれるザリガニパーティにも呼んでもらったのでした。

娘のspring break

San DiegoのFly Meetingから帰ってきた先週月曜日の夜、同じくらいの時間にケンタッキーから飛行機で到着した娘とLafayetteの空港で再会して、空港に停めていた車で家まで帰ってきた。娘は先週スプリングブレイクだということで、その後土曜日までうちでゆっくりしていた。まぁせっかくなので色々と料理してあげたのだが、普段大学のカフェテリアで食べている娘は、たいがいの料理を感動して食べてくれたので作り甲斐があった。特にどこかへ出かけることもしなかったけど、町で色々と買い物をしたり、カフェでゆっくりしたり、大学の美術館を見に行ったり。と言っても、先週うちの大学はまだスプリングブレイクではなく授業もあったので、自分は結構忙しくしていた。うちのスプリングブレイクは今月18日から。ということで19日から約一週間、一時帰国します。京都滞在は21日から24日の予定。